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    EasyScreen工作流程

     更新时间:2018-06-28 点击量:1741

    Genetic Signatures成立于2001年,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)分子生物学部主任)创立。甲基化分析中使用广泛的方法是亚硫酸氢盐法,由Grigg博士在英国剑桥设想,并被减少到CSIRO实验室的实践中[1]。初的方法随后得到改进,这些改进导致了遗传签名MethylEasy™DNA亚硫酸氢钠修饰产品系列的开发和发布。

    由于改进的转化方法和用于胞嘧啶甲基化检测的应用,发现了一个有趣的发现:通过亚硫酸氢钠处理微生物DNA能够将四种核酸碱基还原成仅三个碱基,通过将胞嘧啶转化为胸腺嘧啶。该技术被称为3base ™,是我们的EasyScreen ™病原体检测试剂盒的基石。

    此后,遗传标志开发并商业化了一套基于EasyScreen ™实时PCR的产品,用于常规检测传染病。EasyScreen ™产品为医院和病理实验室提供了分子工具,可在快速高通量的环境中筛查各种传染性病原体。

    样品制备工作流程:

    所述  EasyScreen ™样品处理试剂盒提供直接从主检体的核酸流线型制备。

    该试剂盒可分离 DNA和RNA,并与所有EasyScreen ™病原体检测试剂盒兼容  。

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    自动化NA提取平台兼容性
    遗传签名GS1
    生物梅里埃NucliSENS easyMAG
    Qiagen QIAsymphony,EZ1
    罗氏MagNA Pure 96
    Thermo KingFisher Flex

    一旦使用EasyScreen™样品处理试剂盒 准备好  样品后,可按照 下面的实时PCR工作流程设置任何(或全部)适用的EasyScreen™  病原体检测分析。

    例如,通过将拭子浸入样品并接种EasyScreen TM试剂并如上所述进行操作来制备粪便样品。通过自动核酸提取的提取过程产生足够的洗脱液以执行所有的细菌,病毒和原生动物PCR。

    实时PCR工作流程:

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    实时PCR平台兼容性
    Bio-rad CFX(96和384孔格式)
    罗氏LC480(96和384孔格式)
    Qiagen RotorGene
    Applied Biosystems 7900HT /?? 7500
    Applied Biosystems QuantStudio™5
    Stratagene / Agilent Mx

     

    产品EasyScreen™套件检测到微生物
    EB001和EB001-HT肠道细菌检测(i)沙门氏菌属 
    (ii)弯曲杆菌属Campylobacter spp。)
    (iii)志贺菌属。/肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)
    (iv)小肠结肠炎耶尔森菌。
    (v)产毒的艰难梭菌
    (vi)单核细胞增生李斯特菌
    EP001和EP001-HT肠道原生动物检测(i)隐孢子虫属Cryptosporidium spp。)
    (ii)肠道贾第虫 
    (iii)脆弱东部阿米巴
    (iv)溶组织内阿米巴
    (v)人芽囊原虫Blastocystis hominis)
    EV002和EV002-HT肠道病毒检测(i)诺如病毒GI 
    (ii)诺如病毒GII 
    (iii)星状病毒
    (iv)轮状病毒A 
    (v )沙波病毒
    (vi)肠病毒
    (vii)博卡
    病毒(viii)腺病毒和
    (ix)腺病毒(仅40 + 41)
    CDD001艰难梭菌检测毒素艰难梭菌(目标都TCDA毒素tcdB
    CDD002艰难梭菌反射超致病性艰难梭菌包括 (i)位置117处的tcdC基因缺失,(ii)二元毒素基因(cdtA)和(iii)gyrA基因突变(氟喹诺酮耐药性)的核糖体027和078 ,

     

    英文信息如下:

    ProductEasyScreen™ KitMicroorganisms Detected
    EB001 & EB001-HTEnteric Bacteria Detection(i) Salmonella spp. 
    (ii) Campylobacter spp. 
    (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC)
    (iv) Yersinia enterocolitica. 
    (v) toxigenic C. difficile and 
    (vi) Listeria monocytogenes
    EP001 & EP001-HTEnteric Protozoan Detection(i) Cryptosporidium spp. 
    (ii) Giardia intestinalis 
    (iii) Dientamoeba fragilis 
    (iv) Entamoeba histolytica and 
    (v) Blastocystis hominis
    EV002 & EV002-HTEnteric Viral Detection(i) Norovirus GI
    (ii) Norovirus GII 
    (iii) Astrovirus 
    (iv) Rotavirus A 
    (v) Sapovirus
    (vi) Enterovirus
    (vii) Bocavirus
    (viii) Adenovirus and 
    (ix) Adenovirus (40 + 41 only)
    CDD001C. difficile DetectionToxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB)
    CDD002C. difficile ReflexHypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance)

     

     

    对于HT(384孔格式)试剂盒,所有试剂盒都足够用于100RXNs或500RXNs

    所有  EasyScreen™  病原体检测试剂盒都可用于使用EasyScreen™  样品处理试剂盒准备的  样品。

    有关EasyScreen™  工作流程以及与核酸提取和实时PCR平台的兼容性的更多信息,  请访问我们的  EasyScreen™  工作流程页面。

     

     

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